Η επιλογή των υποψηφίων για κατάταξη πτυχιούχων στο Τμήμα Ιστορίας και Αρχαιολογίας της του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων γίνεται με κατατακτήριες εξετάσεις. Το ποσοστό των κατατάξεων πτυχιούχων ορίζεται κάθε έτος με Υπουργική Απόφαση σε ποσοστό επί του αριθμού των εισακτέων του ίδιου ακαδημαϊκού έτους στο Τμήμα Ιστορίας και Αρχαιολογίας.
Oι υποψήφιοι επιλέγουν είτε την αρχαιολογική είτε την ιστορική κατεύθυνση και εξετάζονται αναλόγως